Produkter

Icke-alkoholisk fettleversjukdom (NAFLD) har ett brett spektrum av sjukdomstillstånd som sträcker sig från mild steatos som kännetecknas av en onormal retention av lipider i leverceller till steatohepatit (NASH) som visar fettansamling, inflammation, ballongbildning och nedbrytning av hepatocyter och fibros.I slutändan kan steatohepatit resultera i levercirros och hepatocellulärt karcinom. I denna studie har vi analyserat tre olika musstammar, A/J, C57BL/6J och PWD/PhJ, som visar olika grader av steatohepatit vid administrering av en 3,5-dietoxikarbonyl. -1,4-dihydrokollidin (DDC) innehållande diet.RNA-Seq genuttrycksanalys, proteinanalys och metabolisk profilering användes för att identifiera differentiellt uttryckta gener/proteiner och störda metabolitnivåer av musleverprover vid DDC-behandling.Väganalys avslöjade förändring av arakidonsyra (AA) och S-adenosylmetionin (SAMe) metabolism på andra vägar.För att förstå metaboliska förändringar av arakidonsyrametabolism i ljuset av sjukdomsuttrycksprofiler utvecklades en kinetisk modell av denna väg och optimerades enligt metabolitnivåer.Därefter användes modellen för att studera silicoeffekter av potentiella läkemedelsmål för steatohepatit. Vi identifierade AA/eicosanoid-metabolism som mycket störd i DDC-inducerade möss med en kombination av en experimentell och i silico-metod.Vår analys av AA/eicosanoid metaboliska vägen tyder på att 5-hydroxieicosatetraenoic acid (5-HETE), 15-hydroxyeicosatetraenoic acid (15-HETE) och prostaglandin D2 (PGD2) är störda i DDC möss.Vi visar vidare att en dynamisk modell kan användas för kvalitativ förutsägelse av metabola förändringar baserat på transkriptomiska data i ett sjukdomsrelaterat sammanhang.Dessutom identifierades SAMe-metabolism som störd på grund av DDC-behandling.Flera gener såväl som några metaboliter i denna modul visar skillnader mellan A/J och C57BL/6J å ena sidan och PWD/PhJ å andra sidan.