Produkter

Infraröd spektroskopi har använts för att kartlägga interaktioner mellan substrat och protein: konformationsförändringarna av det sarkoplasmatiska retikulum Ca(2+)-ATPas vid nukleotidbindning och ATPas-fosforylering övervakades med användning av substrat-ATP- och ATP-analogerna (2'-deoxi-ATP, 3 '-deoxi-ATP och inosin 5'-trifosfat), som modifierades vid specifika funktionella grupper av substratet.Modifieringar av 2'-OH, 3'-OH och aminogruppen i adenin minskar graden av bindningsinducerad konformationsförändring av ATPaset, med särskilt starka effekter observerade för de två sistnämnda.Detta visar den strukturella känsligheten hos nukleotid-ATPas-komplexet för individuella interaktioner mellan nukleotid och ATPas.Alla studerade grupper är viktiga för bindning och interaktioner mellan en given ligandgrupp och ATPas beror på interaktioner mellan andra ligandgrupper.Fosforylering av ATPas observerades för ITP och 2'-deoxi-ATP, men inte för 3'-deoxi-ATP.Det finns ingen direkt koppling mellan graden av konformationsförändring vid nukleotidbindning och fosforyleringshastigheten, vilket visar att den fulla omfattningen av den ATP-inducerade konformationsförändringen inte är obligatorisk för fosforylering.Som observerats för nukleotid-ATPas-komplexet beror konformationen av den första fosforylerade ATPas-intermediären E1PCa(2) också på nukleotiden, vilket indikerar att ATPas-tillstånd har en mindre enhetlig konformation än vad som tidigare förväntats.