Produkter

Den förutsägbara 3D-strukturen av dubbelsträngat DNA gör det idealiskt som en mall för designen nerifrån och upp av funktionaliserade nukleinsyrabaserade aktiva platser.Vi utforskar här användningen av en 14mer DNA-duplex som en ställning för den exakta och förutsägbara positioneringen av katalytiska funktioner.Med tanke på det allestädes närvarande deltagandet av den histidinbaserade imidazolgruppen i proteinigenkänning och katalyshändelser, undersöktes enstaka histidinliknande modifierade duplex.Att binda histamin till C5 i tyminbasen via en amidbindning möjliggör flexibel placering av imidazolfunktionen i huvudspåret.De ömsesidiga interaktionerna mellan imidazolen och duplexen och dess inverkan på imidazolium pKaH undersöks genom att placera en enda modifierad tymin i fyra olika positioner i mitten av 14-mer dubbelhelixen.Med hjälp av NMR och ohämmad molekylär dynamik etableras ett strukturellt motiv som involverar bildandet av en vätebindning mellan imidazolen och Hoogste en-sidan av guaninbaserna hos två närliggande GC-baspar.Motivet bidrar till en stabilisering mot termisk smältning på 6°C och är nyckeln till att modulera pKaH för imidazoliumgruppen.De allmänna egenskaperna, förutsättningarna och generiska karaktären hos det nya pKaH-reglerande motivet beskrivs.