Produkter

Genomomfattande kromatinimmunoprecipitationsstudier (ChIP) har gett betydande insikt i den genomiska lokaliseringen av kromatinassocierade proteiner och histonmodifieringar.Den stora mängden data som genereras av dessa analyser kräver dock tillvägagångssätt som möjliggör snabb validering och analys av biologisk relevans.Dessutom finns det fortfarande protein- och modifieringsmål som är svåra att upptäcka med vanliga ChIP-metoder.För att lösa dessa problem utvecklade vi en omedelbar kromatinimmunfällningsprocedur som vi kallar ZipChip.ZipChip minskar tiden avsevärt och ökar känsligheten vilket möjliggör snabb screening av flera loci.Här beskriver vi hur ZipChIP möjliggör detektering av histonmodifieringar (H3K4 mono- och trimetylering) och två jästhistondemetylaser, Jhd2 och Rph1, som tidigare var svåra att upptäcka med standardmetoder.Dessutom visar vi mångsidigheten hos ZipChIP genom att analysera anrikningen av histon-deacet-ylaset Sir2 vid heterochromatin i jäst och anrikningen av kromatinremodelleraren, PICKLE, vid euchromatin i Arabidopsis thaliana.